Tidak hanya sebagai unit penelitian, HDSS Sleman mendukung peningkatan luaran proses pendidikan dengan menerima mahasiswa kerja praktik atau magang. Kegiatan magang tidak hanya terlibat dalam kegiatan rutin, tetapi juga memberikan kontribusi penting terhadap beberapa Sustainable Development Goals (SDGs) atau Tujuan Pembangunan Berkelanjutan terutama SDG 4.
HDSS Sleman mulai menerima mahasiswa magang sejak tahun 2020. Mahasiswa yang melakukan magang di HDSS Sleman berasal dari berbagai program studi diantaranya yaitu gizi kesehatan dan statistika. Selain itu, HDSS Sleman juga pernah menerima mahasiswa magang dari program studi S1 kedokteran dan S2 Global Health dari University of Gothenburg.